刚开始的时候我的配置文件在同名目录下都是在/mapper下，导致只能读取一个jar中的mapper文件。先解决如下：
1.将mapper文件放在不能放在同名的目录下。
       比如：user.jar放在/user下，common.jar放在common下
2.在Spring中配置  (记住：classpath后跟*号)
<bean id="sqlSessionFactory" class="org.mybatis.spring.SqlSessionFactoryBean">
    <property name="mapperLocations">
       <array>
           <value>classpath*:user/*.xml</value>
           <value>classpath*:common/*.xml</value>
       </array>
    </property>

</bean>

这样就可以读取到了